Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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