Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sh3rf1Q69ZI1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sh3rf1Q69ZI1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sh3rf1Q69ZI1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sh3rf1Q69ZI1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sh3rf1Q69ZI1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sh3rf1Q69ZI1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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