Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pkp4Q68FH0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pkp4Q68FH0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pkp4Q68FH0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pkp4Q68FH0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pkp4Q68FH0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pkp4Q68FH0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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