Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg9aQ68FE2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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