Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms