Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VclQ64727 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VclQ64727 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VclQ64727 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VclQ64727 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VclQ64727 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms