Protein–RNA interactions for Protein: Q64704

Stx3, Syntaxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx3Q64704 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx3Q64704 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms