Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ca4Q64444 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca4Q64444 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms