Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms