Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms