Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ScxQ64124 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms