Protein–RNA interactions for Protein: Q640P7

Tbccd1, TBCC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbccd1Q640P7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tbccd1Q640P7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbccd1Q640P7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms