Protein–RNA interactions for Protein: Q62433

Ndrg1, Protein NDRG1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg1Q62433 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms