Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SnrpaQ62189 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms