Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ttf1Q62187 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ttf1Q62187 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ttf1Q62187 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ttf1Q62187 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ttf1Q62187 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ttf1Q62187 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ttf1Q62187 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ttf1Q62187 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ttf1Q62187 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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