Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

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Length 760 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4aQ62178 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4aQ62178 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4aQ62178 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4aQ62178 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4aQ62178 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4aQ62178 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4aQ62178 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4aQ62178 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4aQ62178 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4aQ62178 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4aQ62178 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4aQ62178 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4aQ62178 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4aQ62178 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4aQ62178 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema4aQ62178 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4aQ62178 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms