Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SspnQ62147 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SspnQ62147 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SspnQ62147 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SspnQ62147 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SspnQ62147 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SspnQ62147 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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