Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Lrrn1Q61809 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Lrrn1Q61809 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrn1Q61809 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Lrrn1Q61809 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Lrrn1Q61809 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Lrrn1Q61809 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Lrrn1Q61809 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrn1Q61809 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrn1Q61809 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrn1Q61809 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Lrrn1Q61809 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrn1Q61809 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrn1Q61809 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Lrrn1Q61809 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Lrrn1Q61809 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrn1Q61809 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Lrrn1Q61809 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrn1Q61809 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrn1Q61809 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrn1Q61809 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrn1Q61809 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrn1Q61809 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrn1Q61809 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrn1Q61809 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrn1Q61809 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrn1Q61809 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrn1Q61809 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrn1Q61809 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Lrrn1Q61809 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrn1Q61809 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrn1Q61809 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrn1Q61809 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrn1Q61809 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms