Protein–RNA interactions for Protein: Q61481

Pde1a, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1A, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1aQ61481 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Pde1aQ61481 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde1aQ61481 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde1aQ61481 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde1aQ61481 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde1aQ61481 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pde1aQ61481 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pde1aQ61481 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pde1aQ61481 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pde1aQ61481 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pde1aQ61481 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pde1aQ61481 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pde1aQ61481 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde1aQ61481 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pde1aQ61481 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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