Protein–RNA interactions for Protein: Q61468

Msln, Mesothelin, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MslnQ61468 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MslnQ61468 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MslnQ61468 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MslnQ61468 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms