Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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