Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms