Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms