Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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