Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HellsQ60848 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HellsQ60848 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HellsQ60848 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HellsQ60848 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HellsQ60848 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HellsQ60848 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms