Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf4Q60793 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms