Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha1Q60750 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha1Q60750 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha1Q60750 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha1Q60750 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha1Q60750 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha1Q60750 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha1Q60750 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha1Q60750 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha1Q60750 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha1Q60750 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha1Q60750 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha1Q60750 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha1Q60750 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha1Q60750 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha1Q60750 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha1Q60750 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha1Q60750 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms