Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms