Protein–RNA interactions for Protein: Q5U406

Zfp78, Zinc finger protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp78Q5U406 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Zfp78Q5U406 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Zfp78Q5U406 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Zfp78Q5U406 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Zfp78Q5U406 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Zfp78Q5U406 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Zfp78Q5U406 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Zfp78Q5U406 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Zfp78Q5U406 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Zfp78Q5U406 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Zfp78Q5U406 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp78Q5U406 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Zfp78Q5U406 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Zfp78Q5U406 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Zfp78Q5U406 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Zfp78Q5U406 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Zfp78Q5U406 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp78Q5U406 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms