Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms