Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWK7

Rnf145, RING finger protein 145, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf145Q5SWK7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf145Q5SWK7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms