Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh2Q5SW75 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh2Q5SW75 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh2Q5SW75 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh2Q5SW75 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh2Q5SW75 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh2Q5SW75 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh2Q5SW75 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh2Q5SW75 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh2Q5SW75 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh2Q5SW75 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh2Q5SW75 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh2Q5SW75 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh2Q5SW75 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms