Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmprss11eQ5S248 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmprss11eQ5S248 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmprss11eQ5S248 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmprss11eQ5S248 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmprss11eQ5S248 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmprss11eQ5S248 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmprss11eQ5S248 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmprss11eQ5S248 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmprss11eQ5S248 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmprss11eQ5S248 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmprss11eQ5S248 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms