Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Brsk1Q5RJI5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk1Q5RJI5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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