Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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