Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RilpQ5ND29 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms