Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarf1Q5ND28 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms