Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms