Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Trim58Q5NCC9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim58Q5NCC9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Trim58Q5NCC9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Trim58Q5NCC9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Trim58Q5NCC9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Trim58Q5NCC9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim58Q5NCC9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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