Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkaa1Q5EG47 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms