Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT8

Pnma5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma5Q5DTT8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnma5Q5DTT8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms