Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms