Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2f8Q58FA4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2f8Q58FA4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2f8Q58FA4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2f8Q58FA4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
E2f8Q58FA4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
E2f8Q58FA4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2f8Q58FA4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2f8Q58FA4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2f8Q58FA4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms