Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Scn2bQ56A07 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Scn2bQ56A07 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Scn2bQ56A07 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Scn2bQ56A07 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Scn2bQ56A07 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2bQ56A07 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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