Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms