Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox3aQ4TU90 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms