Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trp53i11Q4QQM4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trp53i11Q4QQM4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trp53i11Q4QQM4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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