Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms