Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx25Q3ZT31 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms