Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms